无论采用什么方法，都必须保证在灭菌过程中要避免感染其他微生物，还要注意避免常规实验用品的污染，以保证灭菌后培养基的无菌状态。
培养基的灭菌方法通常有以下几种：
1. 高压蒸汽灭菌法：将培养基装入灭菌器中，通入高压蒸汽，经过一定时间的高温高压处理，使培养基中的微生物完全被杀灭。
2. 干热灭菌法：将培养基置于干热灭菌器内，通过控制温度和时间的方式，使培养基中的微生物被杀灭。
3. 化学灭菌法：将消毒液溶液加入培养基中，使其中的微生物被杀灭。
4. 滤过灭菌法：利用0.22微米过滤器，将培养基滤过，将其中的微生物过滤掉，实现灭菌。